شناسایی محاسباتی فاکتورهای تنظیمی مؤثر در بیماری برونشیت عفونی طیور با استفاده از داده‌های RNA-Seq
Authors
Abstract:
بیماری برونشیت عفونی یکی از بیماریهای ویروسی بسیار عفونی و شایع طیور می‌باشد. در این مطالعه به منظور درک بهتر شبکه تنظیمی درگیر در بیماری برونشیت عفونی، در ابتدا ژن های با بیان بالا و مشابه با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های یک مطالعه RNA-Seq در چهار حالت متفاوت شامل مقایسه‌ی بافت طحال جوجه‌های مبتلا به برونشیت با جوجه‌های سالم با غلظت پایین سرم مانوز باند شده با لکتین در سن یک هفتگی و سه هفتگی و مقایسه‌ی بافت طحال جوجه‌های مبتلا به برونشیت با جوجه‌های سالم با غلظت بالای سرم مانوز باند شده با لکتین در سن یک هفتگی و سه هفتگی شناسایی شد. سپس توالی پروموتری این ژن‌ها جهت شناسایی فاکتورهای رونویسی کاندید درگیر در این مکانسیم استخراج شد. نتایج تجزیه و تحلیل پروموتری با استفاده از نرم‌افزار Genomatix منجر به شناسایی 61 فاکتور رونویسی کاندید جدید احتمالی مؤثر در مراحل تنظیمی برونشیت عفونی گردید. افزون بر این، به منظور مصورسازی شبکه‌های تنظیمی شامل فاکتورهای رونوویسی که ژن‌های مورد نظر را تنظیم می‌کنند از نرم‌افزار Cytoscape استفاده شد. بر اساس نتایج، 61 فاکتور رونویسی کاندید جدید معرفی شده در این مطالعه دارای پتانسیل مناسبی برای بررسی بیشتر در سطح آزمایشگاهی می‌باشند و می‌توانند اطلاعات جدیدی را در درک بهتر شبکه‌ی تنظیمی مؤثر در بیمار برونشیت عفونی طیور فراهم کنند.
similar resources
بررسی شبکه تنظیمی مؤثر در شروع شیردهی در بافت پستان گاو شیری با استفاده از داده‌های RNA-seq
در این مطالعه به منظور درک بهتر شبکه تنظیمی درگیر درشروع شیردهی در بافت پستان گاو شیری، در ابتدا ژن های با بیان بالا با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های RNA-Seq در سه حالت زیر شناسایی گردید: حالت اول) مقایسه بافت پستان گاو شیری در 35 روز قبل از زایمان با 3 روز بعد از زایمان ، حالت دوم) مقایسه بافت پستان گاو شیری در 7 روز قبل از زایمان با 3 روز بعد از زایمان، حالت سوم) مقایسه بافت پستان گاو شی...
full textجداسازی و شناسایی مولکولی ویروس های برونشیت عفونی طیور در مرغداریهای صنعتی ایران
هدف : شناسایی مولکولی ویروسهای برونشیت عفونی طیور به روش RT-PCR/RFLPs از مرغداریهای صنعتی ایران. طرح : مطارعه طولی بین سالهای 1382-1377 نمونه‌ها: نمونه‌های بافتی نای، کلیه و ریه گله‌های مشکوک به بیماری تنفسی. روش : نمونه‌های بافتی ارجاع شده به آزمایشگاه ویروس شناسی طیور بخش بیماریهای طیور دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران طی سالهای 1382-1377 از گله‌های گوشتی و تخمگذار به تخم مرغ‌های جنین دار 9...
full textشناسایی مولکولی سویه های وحشی ویروس برونشیت عفونی طیور در گله های گوشتی واکسینه استان مازندران
بیماری برونشیت عفونی یکی از معضلات مهم صنعت پرورش طیور گوشتی در دنیا است و مطالعات اپیدمیولوژی مولکولی و شناسایی مداوم تغییرات ژنتیکی در میان ویروسهای شایع در مزارع پرورشی نقش مهمی در کنترل، پیشگیری و طراحی واکسن‌های موثر بر علیه بیماری دارد. در تحقیق حاضر مزارع طیور گوشتی مشکوک به بیماری برونشیت عفونی در استان مازندران مورد آزمایش قرار گرفتند. بدین منظور، نمونه‌های سواب نای از 28 گله جوجه گوش...
full textمطالعه ایمینو هیستو شیمیایی ضایعات بیماری برونشیت عفونی طیور سویه بر روی بافت‌های مختلف جوجه‌های سالم
تعداد 30 قطعه جوجه ای که فاقد هرگونه آلودگی با ارگانیسم های اختصاصیSPF() بوده و دارای سن 20 روز بوده‌اند، را از طریق داخل نائی(15 قطعه) و از راه دهانی (15 قطعه) توسط ویروس عامل بیماری برونشیت عفونی طیور با سویه/B793 که از ایران جدا شده است، آلوده گردیدند. دو گروه جوجه SPFهر گروه شامل 15 قطعه جوجه بعنوان گروه های کنترل به روش داخل نائی و دهانی PBC دریافت نمودند. تمام جوجه ها هر روز مشاهده و م...
full textجداسازی و شناسایی مولکولی ویروس های برونشیت عفونی طیور در مرغداریهای صنعتی ایران
هدف : شناسایی مولکولی ویروسهای برونشیت عفونی طیور به روش rt-pcr/rflps از مرغداریهای صنعتی ایران. طرح : مطارعه طولی بین سالهای 1382-1377 نمونه ها: نمونه های بافتی نای، کلیه و ریه گله های مشکوک به بیماری تنفسی. روش : نمونه های بافتی ارجاع شده به آزمایشگاه ویروس شناسی طیور بخش بیماریهای طیور دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران طی سالهای 1382-1377 از گله های گوشتی و تخمگذار به تخم مرغ های جنین دار 9...
full textMy Resources
Journal title
volume 30 issue 2
pages 50- 62
publication date 2017-06-22
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023